In opdracht van het Ministerie van Economische Zaken, Landbouw en Innovatie voert EIM een langjarig onderzoeksprogramma uit over het midden- en kleinbedrijf (MKB) en ondernemerschap. Het ministerie wil hiermee een publieke kennisinfrastructuur met basisinformatie over MKB en ondernemerschap in stand houden, uitbouwen en ontsluiten.

Het programmaonderzoek heeft als doel het leveren van vernieuwende inzichten in het functioneren van MKB en ondernemerschap in Nederland. Het programma levert deze inzichten door relevante, actuele, consistente en betrouwbare data, informatie en kennis op te bouwen en deze ter beschikking te stellen aan de doelgroepen van programma: het beleid, branche- en belangenorganisaties, adviseurs van het MKB, kennisinstellingen, individuele ondernemers, de media en overige gebruikers.

De aansturing van het programmaonderzoek is in handen van een externe programmacommissie onder voorzitterschap van Hans Kamps. De heer Kamps is ondernemer en tevens bestuurlijk actief als voorzitter van de Algemene Bond Uitzendondernemingen en de MOGroep Jeugdzorg. Ook is hij als kroonlid aan de SER verbonden. De overige leden van de commissie zijn dr. W. van den Goorbergh en prof. dr. M.A. Carree. De programmacommissie treedt namens het ministerie op als gedelegeerd 'opdrachtgever' van het programmaonderzoek.

De programmacommissie en EIM worden in hun taak bijgestaan door een externe adviesraad van 10 tot 15 vertegenwoordigers van de doelgroepen van het programma, onder voorzitterschap van prof. drs. J.G. Vianen. De raad ziet erop toe dat het programma aansluit op de maatschappelijke behoefte aan kennis over MKB en ondernemerschap, en doet suggesties voor toekomstig onderzoek. Daarnaast waakt de externe adviesgroep datasets en modellen over de kwaliteit van de datasets en modellen van het programma.